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UDP糖|UDP-木糖(UDP-Xyl)的克隆表达和酶活特性研究

发表于由

UDP-木糖(UDP-Xyl)作为Xyl糖基转移的糖核苷酸供体。

在生物体糖核苷酸合成通路中,UDP-Xyl 由 UDP-glucuronic acid decarboxylase(UXS)催化 UDP-葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)脱羧反应生成,

而UDP-GlcA则由 UDP-glucose dehydrogenase(UGD)催化UDP-葡萄糖(UDP-Glc)脱氢转化生成。

科研人员成功从嗜热菌属Sphaerobacter thermophilus中克隆得到了一种新型UGD和UXS基因。

研究表明StUGD和StUXS具有较高的催化活性、耐高温等特点,适合用于UDP-GlcA和UDP-Xyl的生产应用。

UDP糖|UDP-木糖(UDP-Xyl)的克隆表达和酶活特性研究

上海金畔生物科技有限公司是西北一家专业经营进口生化科研试剂的公司，产品服务于纳米靶向试剂、药物传递系统、点击化学等领域。下面是部分定制产品：

UDP-木糖

UDP-Gal半乳糖
UDP-葡糖醛酸
UDP-半乳糖
UDP-木糖(UDP-Xyl)
UDP-葡糖醛酸(UDP-GlcA)

UDP-Azido-GlcNAc　

UDP-GALNAZ　

UDP-葡萄糖(UDP-Glucose，UDP-Glc)

UDP-6-N3-Glu，尿苷二磷酸-6-叠氮-葡萄糖

产地：上海

纯度：99%

用途：仅用于科研

UDP糖|UDP-木糖(UDP-Xyl)的克隆表达和酶活特性研究

发表于由

UDP-木糖(UDP-Xyl)作为Xyl糖基转移的糖核苷酸供体。

在生物体糖核苷酸合成通路中,UDP-Xyl 由 UDP-glucuronic acid decarboxylase(UXS)催化 UDP-葡萄糖醛酸(UDP-GlcA)脱羧反应生成,

而UDP-GlcA则由 UDP-glucose dehydrogenase(UGD)催化UDP-葡萄糖(UDP-Glc)脱氢转化生成。

科研人员成功从嗜热菌属Sphaerobacter thermophilus中克隆得到了一种新型UGD和UXS基因。

研究表明StUGD和StUXS具有较高的催化活性、耐高温等特点,适合用于UDP-GlcA和UDP-Xyl的生产应用。

UDP糖|UDP-木糖(UDP-Xyl)的克隆表达和酶活特性研究

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UDP-木糖

UDP-Gal半乳糖
UDP-葡糖醛酸
UDP-半乳糖
UDP-木糖(UDP-Xyl)
UDP-葡糖醛酸(UDP-GlcA)

UDP-Azido-GlcNAc　

UDP-GALNAZ　

UDP-葡萄糖(UDP-Glucose，UDP-Glc)

UDP-6-N3-Glu，尿苷二磷酸-6-叠氮-葡萄糖

产地：上海

纯度：99%

用途：仅用于科研

UDP糖|葡萄糖醛酸- 4-异戊二酸酶的机理研究

发表于由

UDP-glucuronic acid (UDP-GlcA)是糖核苷酸生物合成的中心前体，是分别释放udp -半乳糖醛酸(UDP-GalA)和udp -戊糖产物的c4 -外消旋酶和脱羧酶的共同底物。


尽管催化的反应不同，但人们认为这些酶的机制相似，根源在于它们与短链脱氢酶/还原酶(SDR)蛋白超家族的共同成员关系:酶结合的NAD+在底物C4处氧化启动催化途径。


UDP-GlcA c4 -异丙基化反应的机理，与脱羧反应相比，这一反应的机理还有待进一步研究。蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)的UDP-GlcA 4-异丙基酶(UDP-GlcA 4-epimerase)是一种同源二聚体，含有一个NAD+ /亚基(kcat = 0.25±0.01 s-1)。


UDP-GlcA的异丙基化过程是通过从底物C4的氢化物转移到底物C4的氢化物来进行的，同时酶结合的辅助因子在稳定状态下保持其氧化形式(≥97%)，且没有脱羧痕迹。


UDP-GlcA转化的kcat表现为2.0(±0.1)的动力学同位素效应，来源于C4的底物氘化反应。


提出的酶促反应机制包括一个瞬时的udp -4-酮-己糖-醛酸中间体，它的形成总体上是限速的，并受从UDP-GlcA中提取氢化物之前的构象步骤控制。


在动力学缓慢的结合步骤中，对底物的精确定位可能对异丙基嘌呤酶建立立体电子约束很重要，在这种约束下，可有效阻止易变的β-酮酸物种的脱羧。突变和pH研究表明，保守的Tyr149作为底物氧化的催化碱，并表明它参与了底物定位步骤。


综上所述，基于整体机理类比，立体电子控制可能是具有UDP-GlcA活性的sdr型异丙基化酶和脱羧酶催化的一个显著特征。

UDP糖|葡萄糖醛酸- 4-异戊二酸酶的机理研究

更多推存

UDP糖|葡萄糖醛酸- 4-异戊二酸酶的机理研究

上海金畔生物科技有限公司是国内光电材料，纳米材料，聚合物；化学试剂供应商；专业于科研试剂的研发生产销售。供应有机发光材料（聚集诱导发光材料）和发光探针（磷脂探针和酶探针）、碳量子点、金属纳米簇；嵌段共聚物等一系列产品。

UDP糖|葡萄糖醛酸- 4-异戊二酸酶的机理研究

发表于由

UDP-glucuronic acid (UDP-GlcA)是糖核苷酸生物合成的中心前体，是分别释放udp -半乳糖醛酸(UDP-GalA)和udp -戊糖产物的c4 -外消旋酶和脱羧酶的共同底物。


尽管催化的反应不同，但人们认为这些酶的机制相似，根源在于它们与短链脱氢酶/还原酶(SDR)蛋白超家族的共同成员关系:酶结合的NAD+在底物C4处氧化启动催化途径。


UDP-GlcA c4 -异丙基化反应的机理，与脱羧反应相比，这一反应的机理还有待进一步研究。蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)的UDP-GlcA 4-异丙基酶(UDP-GlcA 4-epimerase)是一种同源二聚体，含有一个NAD+ /亚基(kcat = 0.25±0.01 s-1)。


UDP-GlcA的异丙基化过程是通过从底物C4的氢化物转移到底物C4的氢化物来进行的，同时酶结合的辅助因子在稳定状态下保持其氧化形式(≥97%)，且没有脱羧痕迹。


UDP-GlcA转化的kcat表现为2.0(±0.1)的动力学同位素效应，来源于C4的底物氘化反应。


提出的酶促反应机制包括一个瞬时的udp -4-酮-己糖-醛酸中间体，它的形成总体上是限速的，并受从UDP-GlcA中提取氢化物之前的构象步骤控制。


在动力学缓慢的结合步骤中，对底物的精确定位可能对异丙基嘌呤酶建立立体电子约束很重要，在这种约束下，可有效阻止易变的β-酮酸物种的脱羧。突变和pH研究表明，保守的Tyr149作为底物氧化的催化碱，并表明它参与了底物定位步骤。


综上所述，基于整体机理类比，立体电子控制可能是具有UDP-GlcA活性的sdr型异丙基化酶和脱羧酶催化的一个显著特征。

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上海金畔生物科技有限公司是国内光电材料，纳米材料，聚合物；化学试剂供应商；专业于科研试剂的研发生产销售。供应有机发光材料（聚集诱导发光材料）和发光探针（磷脂探针和酶探针）、碳量子点、金属纳米簇；嵌段共聚物等一系列产品。sjl2022/02/22