UDP糖|从分子模型的角度研究人类udp -糖基转移酶(UGT)的udp -糖选择性

人尿苷二磷酸(UDP)-糖基转移酶(UGT)超家族的酶通常催化从UDP-糖辅因子到相对小的亲脂化合物的糖的共价加成。


糖偶联物的生物活性通常较低,可提高水溶性,有助于更有效地从体内排出。实验数据表明,UGT蛋白对不同的udp -糖表现出不同的选择性。


虽然UGT蛋白的三维(3D)结构需要深入了解各种UGT蛋白的udp -糖选择性,但目前还没有与udp -糖结合的人类UGT的实验结构。


因此,三维结构的缺乏为在原子水平上分析udp -糖的选择性提出了一个主要的挑战。在这篇评论中,我们着重介绍了比较同源性建模在理解UGT蛋白的udp -糖选择性方面的应用。


c端(CT)结构域的同源性模型表明UGT家族具有高度保守的结构折叠,与UGT2B7-CT x射线晶体结构相比,其主链均方根偏差(rmsds)介于0.066和0.079 Å之间。


该模型表明,CT信号序列末端的四个残基对udp -糖的选择性起着重要作用。n端结构域不太可能与udp -糖的选择性相关,尽管UGT 1和2家族中的保守残基Arg-259 (UGT2B7编号)可能会影响udp -糖的选择性。总的来说,在预测影响udp -糖结合选择性的关键残基方面,该模型与实验观察结果非常一致。

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