DNA提取的类型与基本原则
DNA提取的类型与基本原则
核酸提取通常是开启生物学研究的第一步,而且提取的核酸质量高低也是决定下游实验成败的关键因素之一,那么你知道DNA提取的类型与基本原则是什么吗?让我们一起来看看吧!
一、核酸提取类型:
1.总RNA提取
总RNA中,75-85%为rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其余的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、5S rRNA、5.8S rRNA、miRNA、siRNA、小核RNA及核仁小分子RNA等组成。
2.miRNA提取
MicroRNAs(miRNAs)是小型的、高度保守的RNA分子,如小干扰RNAs(siRNAs),通过与他们的碱基配对调节其同源mRNA的分子表达,以预防通过各种机制的表达。他们已成为进行发育、细胞增殖、分化和细胞周期的重点监管机构。
3.基因组DNA提取
进行基因结构和功能研究以及基因诊断,通常要求得到的片段长度不小于100~200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。
4.质粒抽提
质粒抽提方法即去除RNA,将质粒与细菌基因组DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。
二、DNA提取的基本原则
1.保证DNA结构的完整性
不同的下游实验对于DNA结构的完整性有所区别。如PCR、Southern杂交这一类实验基本保证所需片段的完整,而二代测序实验为了获得全面的序列信息对DNA的完整性要求更高。
2.保证DNA的纯度
去除对下游实验中酶分子有抑制作用的有机溶剂和高浓度金属离子,将蛋白质、多糖、多酚等生物大分子的污染降到低,去除其他核酸。
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