UDP糖|ndp -糖活性SDR酶的结构-功能关系:功能注释和酶工程的指纹图谱

短链脱氢酶/还原酶活性核苷酸糖(简称NS-SDR)在稀有UDP糖和糖苷的生物合成中至关重要。


由于它们在代谢紊乱或毒力因子生物合成中的直接影响,一些家族成员已经被广泛地描述。在这篇综述中,我们将通常只关注一种NS-SDR活性的研究收集到的知识与所有不同的NS-SDR家族(169076个酶序列)的深入分析和概述相结合。


通过这种基于结构的多序列比对从公共数据库中检索到的nssdrs,我们可以识别出关键残基的保存和相关性的清晰模式。在此分析的支持下,我们建议更新并扩展所有NS-SDR酶的udp -半乳糖4-异丙基嘌呤酶的“六方盒模型”为“七方盒模型”。


这个特异性模型包括七个保守区域围绕在UDP糖底物周围,作为每个特异性的指纹。


本综述中所突出的特异性指纹图谱,将有助于对大量NS-SDR酶的功能注释,并对今后以稀有和特殊碳水化合物生物合成为重点的酶工程工作提供指导。

UDP糖|ndp -糖活性SDR酶的结构-功能关系:功能注释和酶工程的指纹图谱

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